| 地区 | 序号 | 单位 | 基地专业 |
| 北京 | JDZ1999001 | 中国中医研究院西苑医院 | 心血管、血液、呼吸、消化、外科、妇科、儿科、神经、内分泌 |
| JDZ1999002 | 中国中医研究院广安门医院 | 肿瘤、皮肤、泌尿、肛肠、眼科、心血管、肾病、糖尿病、风湿、妇科、呼吸 |
| JDZ1999003 | 北京中医药大学东直门医院 | 心血管、肾病、呼吸、消化、脑血管、内分泌（乳腺）、儿科、外科、妇科、抗感染 |
| 天津 | JDZ1999004 | 天津中医学院第一附属医院 | 心血管、儿科、外科 |
| JDZ1999005 | 天津中医学院第二附属医院 | 妇科、心血管 |
| 辽宁 | JDZ1999006 | 辽宁中医学院附属医院 | 血液、外科、妇科、骨科、肾病、肝病 |
| 吉林 | JDZ1999007 | 吉林省中医中药研究院 | 心血管、呼吸 |
| JDZ1999008 | 长春中医学院附属医院 | 脑血管、心血管、消化、妇科、糖尿病、抗感染 |
| 黑龙江 | JDZ1999009 | 黑龙江中医药大学 | 第一附属医院： 呼吸、消化、外科
第二附属医院： 脑血管 |
| 山西 | JDZ1999010 | 山西省中医药研究院 | 消化、肾病 |
| 上海 | JDZ1999011 | 上海中医药大学 | 曙光医院：肝病、骨科
龙华医院：外科（疮疡）、肿瘤
岳阳医院：血液 |
| 江苏 | JDZ1999012 | 南京中医药大学附属医院 | 抗感染、肾病、消化、耳鼻喉、儿科 |
| 浙江 | JDZ1999013 | 浙江省中医院 | 肿瘤、消化 |
| JDZ1999014 | 浙江中医药研究院 | 肿瘤 |
| 安徽 | JDZ1999015 | 安徽中医学院第一附属医院 | 心血管、肾病、神经、骨伤 |
| 福建 | JDZ1999016 | 福建省中医药研究院 | 骨科、心血管、呼吸、脑血管、消化、肾病 |
| 江西 | JDZ1999017 | 江西中医学院附属医院 | 呼吸、消化、肾病、骨伤 |
| 山东 | JDZ1999018 | 山东中医药大学附属医院 | 心血管、血液、内分泌、风湿、妇科 |
| 河南 | JDZ1999019 | 河南省中医学院第一附属医院 | 心血管、消化、儿科、肾病、肛肠、周围血管 |
| JDZ1999020 | 河南省中医药研究院 | 脑血管、心血管、消化、呼吸 |
| 湖北 | JDZ1999021 | 湖北省中医药研究院 | 骨科、肾病、风湿 |
| JDZ1999022 | 湖北中医学院附属医院 | 肝病、妇产科、儿科、呼吸、心血管、外科（肝胆病）、脑血管、口腔 |
| 湖南 | JDZ1999023 | 湖南省中医药研究院附属医院 | 肿瘤、肝病、心血管、脑血管、肾病 |
| JDZ1999024 | 湖南中医学院第一附属医院 | 肝病、呼吸、心血管、眼科、骨伤、糖尿病 |
| 广东 | JDZ1999025 | 广州中医药大学第一附属医院 | 消化、妇科、骨科、外科、肛肠、眼科 |
| JDZ1999026 | 广州中医药大学第二附属医院 | 消化、妇科、骨科、外科、肛肠、眼科 |
| JDZ1999027 | 广州中医药大学粤海医院 | 抗疟疾 |
| JDXZ1999096 | 第一军医大学南方医院 | 肾病、心血管、风湿、脑血管 |
| 广西 | JDZ1999028 | 广西中医学院第一附属医院 | 心血管、骨伤、肛肠、妇产科 |
| 海南 | JDZ1999029 | 海南省中医院 | 骨伤、脑血管、泌尿 |
| 四川 | JDZ1999030 | 成都中医药大学附属医院 | 肾病、眼科、肛肠、皮肤、妇科、呼吸、心血管、消化、儿科 |
| JDXZ1999072 | 华西医科大学第一附属医院 | 呼吸、消化 |
| 云南 | JDZ1999031 | 云南中医学院附属医院 | 肾病、肝病、儿科 |
| 陕西 | JDZ1999032 | 陕西省中医药研究院附属医院 | 心血管、消化、肿瘤、脑血管 |
| 贵州 | JDZ1999033 | 贵阳中医学第一附属医院 | 骨科、肛肠、心血管、内分泌 |
| 新疆 | JDZ1999034 | 新疆维吾尔自治区中医医院 | 骨伤、心血管、脑血管、妇科、儿科、肾病 |
